Buenas noches colega alberto meza, lo adecuado es que al otorgar un instrumento, saques las copias para el Testimonio, la copia para la Sección del Notariado de la CSJ, la copia para tu Archivo Personal.
Luego es importante que no solo lleves un orden sobre las copias de la Escritura Matríz, sino también de los anexos (en los caso que corresponda).