El Sistema Penitenciario cuenta con 19 recintos clasificados según su función, establecida en el Artículo 68 de la Ley Penitenciaria.
1. Centros Preventivos: 4 recintos penitenciarios destinados exclusivamente a la retención y custodia de detenidos provisionalmente por orden judicial. (Artículo 72 Ley Penitenciaria)
● Centro Penitenciario de Sonsonate
● Centro Penitenciario de Ilobasco
● Centro Penitenciario de La Unión
● Centro Preventivo Jucuapa-Hombres.
2. Centros de Cumplimiento de Penas: 3 recintos destinados para los internos que se encuentran en el periodo de ejecución de la Pena. (Artículo 74 Ley Penitenciaria)
● Centro Penal de Usulután
● Centro Penal de Sensuntepeque
● Penitenciaría Occidental de Santa Ana.
3. Centros Mixtos: 10 recintos que albergan a internos procesados y condenados, ubicados en sectores distintos, que por una u otra razón aún no tienen definida legalmente una condena.
● Centro de Readaptación para Mujeres-Ilopango
● Penitenciaría Central "La Esperanza"
● Centro de Cumplimiento de Penas de Ciudad Barrios (M-18)
● Centro Penal de Quezaltepeque (MS)
● Centro Penal de Metapán
● Centro Penal de Apanteos
● Centro Penal de Chalatenango
● Centro Penal de Berlín
● Centro Penal de San Miguel
● Penitenciaría Oriental de San Vicente
4. Centros de Seguridad: 2 recintos que se les ha dado esta clasificación porque resguardan a los internos considerados como de alto índice de peligrosidad y agresividad dentro del sistema penitenciario.
● Centro Penitenciario de Seguridad de Zacatecoluca.
● Centro Penitenciario de San Francisco Gotera.
El siguiente usuario dijo gracias: Raynoldo, cko, Pasante